Il CIRFIM si prefigge di sviluppare le relazioni nazionali e internazionali con Centri di Ricerca, Atenei e altri operatori del settore pubblico e privato interessati alle tematiche oggetto del Centro. A questo fine il CIRFIM si avvale dei ruoli ricoperti e dei contatti intrattenuti dai propri docenti presso istituti e istituzioni, quali:
- Accademia Galileiana di Scienze, Lettere ed Arti (Padova);
- Albertus-Magnus Institut (Köln);
- Aquinas and ‘the Arabs’ International Working Group (Milwaukee);
- Associazione Italiana di Studi Bizantini;
- Biblioteche del Veneto con fondi manoscritti;
- Biblioteca Ambrosiana di Milano;
- CARMEN, The Worldwide Medieval Network;
- Centro Interuniversitario “Greco Arabo Latino” – GRAL (Padova-Pisa);
- Centro Interuniversitario di ricerca di “Studi sulla Tradizione” (Bari-San Marino-Padova-Trento);
- Centro Italiano di Studi sull’Alto Medioevo – CISAM (Spoleto);
- Centro per la Storia dell’Università di Padova;
- Centro per l’Edizione di Testi Filosofici Medievali e Rinascimentali – CETEFIL (Lecce);
- Centro Studi Antoniani (Padova);
- De Wulf-Mansion Centre for Ancient, Medieval and Renaissance Philosophy (Leuven);
- Deputazione di Storia Patria per le Venezie;
- École Pratique des Hautes Études – EPHE (Parigi);
- European Academy of Religion – EUARE;
- Facoltà teologica del Triveneto;
- Fondazione Cini;
- Fondazione per le Scienze Religiose Giovanni XXIII – FSCIRE (Bologna);
- Fondazione Ugo e Olga Levi per gli studi musicali;
- Institut d’études Augustiniennes (Paris);
- Institutum Patristicum Augustinianum (Roma);
- Internationale Gesellschaft für Theologische Mediävistik – IGTM;
- Istituto di Filosofia dell’Università di Varsavia;
- Istituto per la Storia Ecclesiastica Padovana;
- Regione Veneto;
- Società Filosofica Italiana;
- Società Internazionale di Studi Francescani;
- Società Internazionale per lo Studio del Medioevo Latino – SISMEL;
- Società Internazionale Tommaso d’Aquino – SITA;
- Società Italiana per lo Studio del Pensiero Medievale – SISPM;
- Societas Veneta per la Storia Religiosa;
- Société Internationale pour l’étude de la Philosophie Médiévale – SIEPM;
- Société Internationale d’Histoire des Sciences et de la Philosophie Arabes et Islamiques – SIHSPAI (Parigi).
- Zentrum für Augustinusforschung (Würzburg).