Lo Statuto del CIRFIM è stato emanato dal Magnifico Rettore con Decreto Rep. 1474/2013 del 6 giugno 2013 ed è stato modificato dal M.R., su richiesta del CIRFIM, con Decreto Rep. 1476/2016 del 9 giugno 2016 e con Decreto Rep. 3158/2020 del 25 settembre 2020.
In data 20 dicembre 2017, con Decreto Rep. 4478/2017, il Magnifico Rettore ha emanato il Regolamento del CIRFIM. Il M.R. lo ha poi modificato, su richiesta del CIRFIM, con Decreto Rep. 3158/2020 del 25 settembre 2020. Con Decreto Rep. 2929/2022 del 15 luglio 2022, la Magnifica Rettrice ha emanato il nuovo Regolamento del Centro, entrato in vigore il giorno successivo. Il Regolamento rinvia alle Linee di indirizzo per la costituzione, il rinnovo e il funzionamento dei Centri Interdipartimentali di Ricerca emanate dalla M.R. con Decreto Rep. 4428/2021 del 3 dicembre 2021. Il nuovo Regolamento sostituisce il precedente Statuto di cui sopra.